Awọn oniwadi ni Ile-ẹkọ giga Hiroshima sunmọ si idamo awọn ilana molikula lẹhin bii awọn iṣan omi ṣe npa awọn ohun ọgbin ko ni atẹgun. Eyi yoo ṣe iranlọwọ lati ṣẹda awọn irugbin ti o ni irọrun diẹ sii si iṣan omi, awọn ijabọ Phys.org portal.
Gẹ́gẹ́ bí Banki Àgbáyé ti sọ, ìkún-omi jẹ́ ewu àgbáyé tí ó ń halẹ̀ mọ́ ẹ̀mí àti dúkìá ọ̀kẹ́ àìmọye ènìyàn. Ọ̀pọ̀ èèyàn ló wà nínú ewu ebi nítorí ìkún omi, èyí tó lè mú kí àwọn ohun ọ̀gbìn wọ̀. Bayi awọn oniwadi n sunmọ idamo molikula lakọkọ, eyi ti o wa labẹ bi awọn iṣan omi ṣe npa awọn eweko jẹ atẹgun. Eyi yoo ṣe iranlọwọ lati ṣẹda awọn irugbin ti o le.
Nipasẹ awon orisirisi-onínọmbàeyiti o kan tun ṣe atunwo data lati awọn ijinlẹ miiran ni gbogbogbo, ẹgbẹ kan lati Ile-iwe Graduate ti Awọn Imọ-jinlẹ Igbesi aye Integrated ni Ile-ẹkọ giga Hiroshima rii ọpọlọpọ wọpọ awọn Jiini ati awọn ilana ti o somọ ni iresi (Oryza sativa) ati Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). Awọn onimo ijinlẹ sayensi ṣe atẹjade awọn abajade iwadii wọn ninu iwe akọọlẹ naa Life.
"Hypoxia jẹ aapọn abiotic fun awọn eweko, nigbagbogbo ti o fa nipasẹ iṣan omi," ṣe alaye akọwe-iwe iwadi Keita Tamura, ti o tọka si aini ti atẹgun ti o fa nipasẹ oversaturation. “Biotilẹjẹpe ọpọlọpọ awọn iwadii ti ṣe tẹlẹ, a gbagbọ pe o farapamọ ti ibi ise sise le ṣe awari nipasẹ ṣiṣe itupalẹ awọn iwadii pupọ nipa lilo iṣiro-meta ti data ti o wa ni gbangba.”
Ẹgbẹ naa ṣojukọ lori iresi ati omi-omi nitori awọn Jiini ti awọn eya mejeeji ti ṣe iwadi lọpọlọpọ tẹlẹ. Gẹgẹbi Tamura, iresi tun jẹ ọkan ninu awọn irugbin ti o ṣe pataki julọ ni agbaye, ti n ṣiṣẹ bi ipilẹ ọja ounje fun diẹ ẹ sii ju bilionu mẹrin eniyan, ni ibamu si awọn Consultative Group fun International Agricultural Research, ki agbọye bi o lati se kan ọgbin lati fesi si hypoxia, jẹ pataki.
Awọn oniwadi ṣe idanimọ awọn orisii 29 ti data RNA-seq fun Arabidopsis ati awọn orisii 26 fun iresi labẹ mejeeji deede ati awọn ipo aipe atẹgun lati awọn eto data to wa. Gẹgẹbi Ọjọgbọn Hidemasa Bono, ilana-iṣe RNA jẹ pẹlu ṣiṣafihan ipilẹ jiini koko-ọrọ kan ni aaye ti a fun ni akoko kan, afipamo pe data le ṣee lo lati ṣe iwadii iru awọn jiini ti o fa eyiti o yipada.
"Nipa ṣiṣe ayẹwo data RNA-seq, a ṣe idanimọ 40 ati 19 soke- ati isalẹ-ilana awọn Jiini ni awọn eya mejeeji," Bono sọ. Lara iwọnyi, ọpọlọpọ awọn ifosiwewe transcription WRKY ati cinnamate 4-hydroxylase, ti awọn ipa wọn ninu esi hypoxia ko jẹ aimọ, ni gbogbogbo ni a ṣe atunṣe ni Arabidopsis mejeeji ati iresi.”
Ni ibamu si Bono, iṣagbega gbogbogbo yii tumọ si pe awọn ọna ṣiṣe molikula wọnyi yoo ṣiṣẹ diẹ sii nigbati a ko ni atẹgun atẹgun, ti o nfihan pe wọn ni ojuṣe mechanistic kan pato fun bii awọn ohun ọgbin ṣe dahun.
Bono ati Tamura ṣe afiwe awọn abajade wọn pẹlu iru-iṣiro-meta ti hypoxia ninu awọn sẹẹli eniyan ati awọn ayẹwo ara. Wọn rii pe meji ninu awọn Jiini ti a mu ṣiṣẹ ni igbagbogbo ni iresi ati Arabidopsis ni a tẹmọlẹ ninu awọn ẹlẹgbẹ eniyan wọn.
"Onínọmbà meta wa ni imọran awọn ọna ẹrọ molikula ti o yatọ nigba hypoxia ninu awọn eweko ati eranko," Bono sọ. “Awọn jiini oludije ti a damọ ninu iwadii yii ni a nireti lati tan ina sori awọn ọna molikula tuntun ti idahun ọgbin si hypoxia.” Ni ipari, a gbero lati ṣe afọwọyi ọkan ninu awọn jiini oludije nipa lilo imọ-ẹrọ ṣiṣatunṣe genome lati ṣẹda awọn ohun ọgbin ti o farada iṣan-omi.”