D. Yu. Ryazantsev, E. M. Chudinova, L. Yu. Kokaeva, S. N. Elansky, P. N. Balabko, GL Belova, S. K. Zavriev
Awọn fungus phytopathogenic fungus Colletotrichum coccodes fa awọn arun ti o lewu ti poteto ati awọn tomati, ti a mọ si anthracnose ati aaye dudu isu. Da lori awọn abuda ara-ara, wọn nigbagbogbo nira lati ṣe iyatọ si awọn arun ti o fa nipasẹ awọn microorganisms miiran; Lori awọn eso tomati alawọ ewe, arun na le jẹ asymptomatic, ti o han nikan lori awọn eso pupa ti o pọn. Fun iwadii iyara ati deede ti pathogen, a funni ni eto idanwo PCR akoko gidi kan. Lati ṣe agbekalẹ eto idanwo kan, ilana nucleotide ti jiini glycerol triphosphate dehydrogenase jẹ ipinnu fun awọn igara 45 ti C. coccodes ti o ya sọtọ lati awọn isu ọdunkun ni awọn agbegbe oriṣiriṣi ti Russia.
Da lori awọn abajade ti o gba ati itupalẹ awọn ilana ti o jọra ti awọn eya miiran ti o wa ni ibi ipamọ data GenBank, awọn ipilẹ-ẹya kan pato ati iwadii jẹ apẹrẹ fun C. coccodes. Lati ṣayẹwo pato ti eto idanwo ti a ṣẹda, PCR ni a ṣe pẹlu DNA ti o ya sọtọ lati awọn aṣa mimọ ti 15 oriṣiriṣi oriṣi ti parasitic ati saprotrophic elu ti o ni nkan ṣe pẹlu awọn tomati ati awọn irugbin ọdunkun (Fusarium oxysporum, F. verticillium, Phomopsis phaseoli, Alternaria alternata, Helminthosporium solani). , Colletotrichum coccodes, Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Helminthosporium solani, Phomopsis phaseoli, Neonectria radicicola, Rhizoctonia solani, Penicillium sp., Cladosporium fulvum, C. cladosporiodes). Iwaju ti Colletotrichum coccodes DNA ni a rii ni ọna ọna ti 20-27, lakoko ti a ti rii awọn eya miiran lẹhin awọn akoko 40 tabi ko rii. Eto idanwo naa ngbanilaaye lati rii igbẹkẹle C. coccodes awọn ifọkansi DNA ti o kọja 0.01 ng/mm3 ninu idapọ PCR ti a ṣe itupalẹ. Lilo eto idanwo ti o dagbasoke, wiwa C. coccodes ni a ṣe iwadi ni awọn ewe tomati pẹlu awọn ami aisan ti awọn arun olu ati ninu isu ọdunkun laisi awọn ami ita gbangba ti arun na. Awọn ewe pẹlu awọn aami aiṣan ti ikolu olu ni a gba lati awọn aaye oriṣiriṣi meji ni agbegbe Krasnodar, isu - lati awọn aaye ni Kostroma, Moscow, Kaluga, ati awọn agbegbe Nizhny Novgorod. Ni agbegbe Krasnodar, ewe tomati kan ti o ni C. coccodes DNA ni a ri; wiwa igbẹkẹle ti DNA ti pathogen yii ni a rii ni awọn ayẹwo 5 ti isu ti o dagba ni awọn agbegbe Kostroma, Moscow, ati Kaluga.
Ifihan
Awọn elu ti iwin Colletotrichum jẹ awọn phytopathogens ti o lewu ti o kọlu awọn irugbin, ẹfọ, ewebe, ati eso aladun ati awọn irugbin Berry. Ọkan ninu awọn eya ibigbogbo ti iwin yii, Colletotrichum coccodes (Wallr).
Hughes, jẹ aṣoju okunfa ti anthracnose ati aaye dudu ti poteto ati awọn tomati, ati fa awọn arun ti nọmba awọn irugbin miiran ti idile nightshade, pẹlu. èpo (Dillard, 1992). C. coccodes infects gbogbo ipamo awọn ẹya ara ti awọn ọgbin, yio ìtẹlẹ, leaves ati eso (Andrivon et al., 1998; Johnson, 1994). Lori awọ ara ti awọn isu ọdunkun ti o ni arun, idagbasoke ti awọn aaye grẹy pẹlu awọn egbegbe ti a ti ṣalaye ni a ṣe akiyesi, lori eyiti awọn aaye dudu ti sporulation ati microsclerotia han kedere. Lakoko ibi ipamọ, awọn ọgbẹ pẹlu awọn akoonu rirọ le dagba ninu apo isu, i.e. Arun naa wọ inu ipele anthracnose, eyiti, sibẹsibẹ, jẹ toje pupọ.
Ni akoko kanna, awọn aami aiṣan ti anthracnose (awọn ọgbẹ ti a bo pẹlu awọ ara pẹlu awọn aami dudu kekere) jẹ aṣoju lori awọn eso tomati. Lori awọn ewe, awọn aami aiṣan ti C. coccodes awọn egbo han bi awọn aaye dudu dudu, nigbagbogbo ni agbegbe nipasẹ awọ ofeefee (Johnson, 1994).
Awọn idagbasoke ti dudu spotting lori isu spoils irisi wọn, eyi ti o ti wa ni paapa oyè nigbati awọn fo fo poteto poteto. Iyapa Peeli yori si evaporation pupọ ati awọn adanu ibi ipamọ ti o pọ si (Ebi ati McIntyre, 1979). Bibajẹ si awọn ẹya ara ọgbin miiran nyorisi awọn adanu ikore, eyiti a ṣe akiyesi ni ṣiṣi ati awọn ipo ilẹ pipade (Johnson, 1994; Tsror et al., 1999). Awọn arun ti o ṣẹlẹ nipasẹ C. coccodes ni o wọpọ ni gbogbo awọn agbegbe ti o nmu ọdunkun ti aye, pẹlu Russia (Leesa, Hilton, 2003; Belov et al, 2018). Iṣakoso ti awọn arun jẹ nira nitori aito ndin ti wa tẹlẹ fungicides lodi si C. coccodes ati aini ti sooro orisirisi (Ka ati Ìbòmọlẹ, 1995).
Awọn inoculum ti C. coccodes le wa ni ipamọ ni awọn isu irugbin (Ka ati Hide, 1988; Johnson et al., 1997), awọn irugbin tomati (Ben-Daniel et al., 2010), ki o si ye fun igba pipẹ ninu ile ati lori awọn idoti ọgbin (Dillard, 1990; Dillard, Cobb, 1993) ati ninu awọn èpo (Raid, Pennypacker, 1987). Awọn iṣẹ ti nọmba kan ti awọn onkọwe (Ka, Hide, 1988; Barkdoll, Davis, 1992; Johnson et al., 1997; Dillard, Cobb, 1993) ti fihan pe idagbasoke arun na lori poteto ati awọn tomati ni pataki da lori wiwa. ti inoculum ninu ohun elo irugbin ati ni ile. Nitorinaa, lati dinku awọn adanu lati arun na, o jẹ dandan lati ṣe iwadii (pẹlu pipo) awọn ikede olu ni ohun elo irugbin, ni ile, ni awọn isu irugbin ọdunkun ati awọn irugbin tomati ti o fipamọ fun ibi ipamọ. Awọn iwadii aisan ara ni ile ati ohun elo ọgbin le ṣee ṣe nikan nipasẹ wiwa microsclerotia, eyiti, sibẹsibẹ, tun wa ni awọn iru elu miiran.
Awọn aami aisan ti awọn isu jẹ iru pupọ si scab fadaka, ti o fa nipasẹ fungus Helminthosporium solani. Ipinya ti Colletotrichum coccodes ati Helminthosporium solani sinu aṣa mimọ jẹ ohun ti o nira pupọ ati pe o gba akoko pipẹ nitori idagbasoke ti o lọra lori alabọde ounjẹ. Lati ṣe idanimọ awọn coccodes Colletotrichum ni kiakia, o jẹ dandan lati lo awọn ọna iwadii ohun elo. Ọna ti o rọrun julọ ni iṣesi polymerase pq (PCR) ati iyipada rẹ - PCR akoko gidi. Lọwọlọwọ, ni Yuroopu ati AMẸRIKA, eto idanwo ti o dagbasoke nipasẹ awọn oniwadi Gẹẹsi (Cullen et al., 2002) fun agbegbe ITS1 ti rDNA ti lo. Lilo rẹ tun ṣe afihan awọn abajade to dara ni itupalẹ awọn ipinya ti Russia (Belov et al, 2018). Sibẹsibẹ, C. coccodes jẹ iyipada pupọ ati wiwa rẹ nipa lilo ọna DNA kan le ja si awọn abajade odi eke. Fun igbẹkẹle iwadii ti o tobi julọ, a nilo itupalẹ ti ọpọlọpọ awọn iru-ẹya-pato DNA lesese, ati nitori naa a ti ṣe agbekalẹ eto idanwo atilẹba ti o fun wa laaye lati ṣe idanimọ C. coccodes nipasẹ ọna ti jiini glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
awon nkan ise nkan ati awon ona lati se nkan
Lati ṣe ayẹwo imunadoko ati pato ti awọn eto idanwo ti a ṣẹda, awọn aṣa mimọ ti awọn eya 15 ti elu ti o ya sọtọ nipasẹ awọn onkọwe lati awọn apẹẹrẹ ti o kan ti awọn ewe tomati ati awọn eso ati awọn isu ọdunkun ni a lo (Table 1). Fun ipinya, awọn ara ọgbin pẹlu awọn aami aiṣan ti akoran olu ni a mu, ko ju ẹyọkan lọ fun igbo kan.
Apa kan ti isu kan pẹlu peeli, ege eso tomati kan, tabi ewe ti o kan ni a gbe labẹ microscope binocular, lẹhin eyi ti mycelium, spores tabi nkan ti ara ti a gbe lọ si alabọde agar (wort agar) ninu satelaiti Petri kan. pÆlú abẹrẹ dídán yòókù. Awọn iyasọtọ ti wa ni ipamọ sori awọn slants agar ninu awọn tubes idanwo ni 4°C.
Awọn apẹẹrẹ ti awọn ewe tomati ti a pinnu fun itupalẹ pẹlu awọn aami aiṣan ti awọn arun olu lẹsẹkẹsẹ lẹhin gbigba (ni aaye) ni a gbe sinu 70% oti ethyl ninu eyiti a ti fipamọ wọn titi di isediwon DNA. Awọn isu ọdunkun ni a fi jiṣẹ si yàrá-yàrá, ti a bó (ege 2 × 1 cm) ati didi ni -20°C. Wọn ti fipamọ ni aotoju titi ti isediwon DNA.
Awọn aṣa mimọ ti elu fun isediwon DNA ni a dagba ni alabọde pea olomi. A ti yọ mycelium olu kuro ninu alabọde olomi, ti o gbẹ lori iwe àlẹmọ, tio tutunini ninu omi nitrogen, homogenized, incubated in CTAB buffer, purified with chloroform, precipitated with a mix of isopropanol and 0.5 M potassium acetate, ati ki o fo lemeji pẹlu 2% oti 70% oti. . Abajade DNA ti wa ni tituka ni omi ti a ti sọ diionized ati ti o fipamọ ni -20 ° C (Kutuzova et al., 2017). Iwọn ifọkansi DNA ni lilo ohun elo titobi DNA HS fun DNA ala-meji lori Qubit 3.0 (Qiagen, Jẹmánì). Awọn ayẹwo ti a fipamọ ati tio tutunini jẹ ilẹ ni nitrogen olomi, lẹhinna DNA ti ya sọtọ gẹgẹbi a ti ṣalaye loke (fun mycelium ti awọn aṣa olu mimọ).
Table 1. Oti ti awọn igara olu ti a lo ninu iṣẹ yii
Orukọ olu | ọgbin, ẹya ara | Ibi ti yiyan |
---|---|---|
Colletotrichum coccodes 1, C. coccodes 2, C. coccodes 3, Ilyonectria crassa, Rhizoctonia solani | isu ọdunkun | Agbegbe Kostroma, awọn isu ọdunkun ti iran aaye 1st, Red Scarlett orisirisi |
Colletotrichum coccodes 4 | ewe ọdunkun | Aṣoju. Mari El, Yoshkar-Ola |
Helminthosporium Solani | isu ọdunkun | agbegbe Magadan, pos. Agọ, isu ọdunkun |
Cladosporium fulvum | ewe tomati | Agbegbe Moscow, tomati nla-eso |
Alternaria tomatiphila | eso tomati | gbigbe nipasẹ awọn oṣiṣẹ ti yàrá ti mycology ati phytopathology ti Ile-iṣẹ Iwadi Gbogbo-Russian ti Idaabobo Ohun ọgbin |
Fusarium verticillium, Phomopsisphaseoli, Alternaria alternata, Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Cladosporium cladosporioides, Acrodontium luzulae, Penicillium sp. | eso tomati | Agbegbe Krasnodar, agbegbe Crimean, orisirisi Slivka |
Fusarium oxysporum | root alikama | Agbegbe Moscow |
PCR ti ṣe ni lilo ampilifaya DTprime (DNA-Technology). Lati ṣe PCR, a lo awọn alakoko atilẹba ati iwadii kan fun agbegbe-ẹya kan pato ti jiini glycerol triphosphate dehydrogenase: alakoko iwaju Coc70gdf –TCATGATATCATTTCTCACGCA, alakoko yiyipada Coc280gdr – TACTTTGAGCATGTAGGCCTGGGA –-GTTGAGCATGTAGGCCTGGGA – Probe Coc GGGCTGCTGCCG(p). Awọn alakoko mu agbegbe 1 bp pọ si.
Idahun naa jẹ 50 ng ti DNA lapapọ (nigbati o ṣe itupalẹ awọn ewe ati isu) ati 10 ng (nigbati o ṣe itupalẹ DNA lati awọn aṣa olu mimọ). Adalu ifaseyin (35 μl) ti pin si awọn ẹya meji nipasẹ Layer paraffin: ọkan ti o kere julọ (20 μl) ni 2 μl ti 10 × ifasimu ifasilẹ (750 mM Tris-HCl, pH 8.8; 200 mM (NH4) 2SO4; 25 mM MgCl2; 0.1% Tween- 20), 0.5 mM kọọkan deoxynucleotide triphosphate, 7 pmol kọọkan alakoko ati 4 pmol hydrolyzable fluorescent ibere; oke ti o wa ninu 1 μl ti 10 × PCR buffer ati 1 kuro ti Taq polymerase.
Yiya sọtọ adalu pẹlu paraffin gba awọn tubes laaye lati wa ni ipamọ fun igba pipẹ ni iwọn otutu ti 5 ° C ati lati rii daju ibẹrẹ gbigbona ti PCR lẹhin ti wọn ti gbona fun iṣẹju mẹwa 10 ni iwọn otutu ju 80 ° C. PCR ni a ṣe ni ibamu si eto atẹle: 94.0 ° C - 90 s (1 ọmọ); 94.0 ° C - 30 s; 64.0 ° C - 15 s (5 cycles); 94.0 ° C - 10 s; 64.0°C – 15 s (45 cycles); 10.0 ° C - ipamọ.
Awọn abajade ati ijiroro
Awọn ilana ti jiini glycerol triphosphate dehydrogenase ni a pinnu ni awọn igara 45 ti o ya sọtọ lati awọn ewe, awọn eso, isu ọdunkun ati awọn eso tomati (Kutuzova, 2018) ni awọn agbegbe oriṣiriṣi ti Russia. Awọn ilana iwadi ti gbogbo awọn igara ni a pin si awọn ẹgbẹ meji, ti o yatọ ni awọn nucleotides meji. Awọn ilana nucleotide ti awọn aṣoju ti awọn ẹgbẹ mejeeji ti wa ni ipamọ ni GenBank labẹ awọn nọmba KY2 ati KY496634.
Awọn alakoko coc70gdf, coc280gdr ati cocgdz iwadi ti a ṣe lori ipilẹ wọn ni a ṣayẹwo ni lilo eto BLAST (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) lori gbogbo awọn ilana jiini glycerol triphosphate dehydrogenase ti o wa ni ibi ipamọ data GenBank lati awọn eya ti iwin Colletotrichum ati awọn oganisimu miiran.
Ko si awọn ẹkun DNA ti awọn oganisimu miiran ti o ni isokan pupọ si awọn alakoko ati iwadii ni a rii.
A ṣe idanwo ifamọ ti eto idanwo naa nipa lilo awọn ayẹwo pẹlu awọn ifọkansi oriṣiriṣi ti C. coccodes DNA, DNA lati inu ewe ọdunkun kan ti o ni ipa nipasẹ anthracnose (ti a gba ni 2017 ni Mari El, Red Scarlett orisirisi), ati awọn peels tuber ti o ni ipa nipasẹ aaye dudu (ti a kojọ sinu) agbegbe Kostroma, Red Scarlett orisirisi, Table 2). Lati jẹrisi wiwa DNA ninu isu ati awọn ewe ọdunkun, awọn igara C. coccodes ni a ya sọtọ lati ọdọ wọn sinu awọn aṣa mimọ.
Awọn abajade ti iṣiro ifamọ ti eto idanwo fihan pe o le ṣee lo lati ṣe iwadii aṣeyọri wiwa ti C. coccodes DNA ninu apẹẹrẹ ti akoonu rẹ lapapọ ninu adalu PCR jẹ diẹ sii ju 0.05 ng. Eyi to fun wiwa, nitori ọkan sclerotia ni ni apapọ 0.131 ng, ati ọkan spore - nipa 0.04 ng ti DNA (Cullen et al., 2002). Eto idanwo ti o ni idagbasoke nipasẹ ẹgbẹ Gẹẹsi (Cullen et al., 2002) ṣe afihan iru ifamọ (ilana 34 ni 0.05 ng ti DNA ati 37 ni 0.005 ng).
Onínọmbà ti awọn apẹẹrẹ adayeba ti o ni awọn coccodes C. ni gbogbo awọn ọran jẹ ki o ṣee ṣe lati rii daju wiwa rẹ ninu apẹẹrẹ (Table 2). Ọna ti a dabaa fun isediwon DNA tun tan lati wulo fun itupalẹ awọn ayẹwo ọgbin adayeba.
Tabili 2. Ipinnu ifamọ ti eto idanwo idanimọ Colletotrichum coccodes fun PCR akoko gidi
Ayẹwo | Iye DNA ninu ayẹwo *, ng | Iwọn ala-ilẹ | Iwari ti C. coccodes |
---|---|---|---|
Mycelium ti Colletotrichum coccodes | 50 | 21.3 | + |
5 | 25.7 | + | |
0.5 | 29,7 | + | |
0.05 | 33.5 | + | |
0.005 | 40 | - | |
0.0005 | 42.8 | - | |
0.00005 | - | ||
Peeli tube 1 | 50 | 32 | + |
Peeli tube 2 | 50 | 30 | + |
Peeli tube 3 | 50 | 31.5 | + |
ewe ọdunkun | 50 | 29.5 | + |
Akiyesi. * Ni adalu PCR awọn ọja.
Ni pato ti eto idanwo naa ni idanwo lori awọn ayẹwo DNA ti a fa jade lati oriṣi 15 ti elu. Gbogbo awọn igara olu ni o ya sọtọ nipasẹ awọn onkọwe lati awọn eso tomati ti o ni ilera ati ti ilera, ati isu ọdunkun; igara kan ti ya sọtọ lati gbongbo alikama (Table 1). Lara awọn ti o ya sọtọ lati oju ti eso naa tun wa awọn eya ti kii ṣe pathogenic fun tomati (fun apẹẹrẹ, Phellinus ferrugineovelutinus).
Awọn ẹkọ-ẹkọ ti fihan pe C. coccodes DNA ni a rii ni ọna ọna ti 20-27, lakoko ti a ko ri awọn eya olu miiran tabi fun ifihan agbara lẹhin 40 ọmọ, eyi ti a le sọ si ipa ariwo ti kii ṣe pato (Table 3).
Table 3. Igbeyewo eto igbeyewo lori orisirisi orisi ti olu
Orukọ olu | Iwọn ala-ilẹ |
Awọn coccodes Colletotrichum 1 | 20.9 |
C. awọn coccodes 2 | 22.6 |
C. awọn coccodes 3 | 23 |
C. awọn coccodes 4 | 22 |
Fusarium oxysporum | > 40 |
F. verticillium | > 40 |
Rhizoctonia Solani | > 40 |
Phomopsis faseoli | > 40 |
Alternaria alternata | > 40 |
A. tomatifila | > 40 |
Helminthosporium Solani | > 40 |
Phellinus ferrugineovelutinus | > 40 |
Stemphylium vesicarium | > 40 |
Ilyonectria crassa | > 40 |
Cladosporium cladosporioides | > 40 |
C. fulvum | > 40 |
Acrodontium luzulae | > 40 |
Penikillium sp. | > 40 |
Akiyesi. * Iye DNA ni gbogbo awọn ayẹwo jẹ 10 ng.
Eto idanwo ti o ni idagbasoke ni a lo lati ṣe idanimọ C. coccodes ni awọn ayẹwo ti awọn ewe tomati pẹlu awọn aami aiṣan ti ibajẹ nipasẹ awọn aarun necrotrophic ati awọn isu ọdunkun irugbin laisi awọn ami aisan ti o han. Fun iwadi naa, awọn isu irugbin ti awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi ti o dagba ni awọn agbegbe Kostroma, Moscow, Kaluga, ati Nizhny Novgorod ni a mu. Iwaju ti C. coccodes DNA ni a kà ni igbẹkẹle ninu awọn ayẹwo ninu eyiti iwọn ila-ilẹ ko kọja 35. Iwọn ila-ilẹ yii ni a yan da lori wiwa ti o gbẹkẹle ti 0.05 ng ti C. coccodes DNA (ala-ilẹ 33.5, Table 2) ati awọn Ni otitọ pe nigbati Ni awọn iyipo ala ti o ju 40 lọ, DNA ti kii ṣe pato ti diẹ ninu awọn eya olu miiran ni a ṣe ayẹwo. Pẹlu ọna yii, wiwa ti o gbẹkẹle ti C. coccodes DNA ni a ri ni awọn ayẹwo 5 ti awọn isu ti o dagba ni awọn agbegbe Kostroma, Moscow, Kaluga ati ninu ewe tomati kan lati agbegbe Yeisk ti agbegbe Krasnodar (Awọn tabili 4, 5).
Tabili 4. Wiwa awọn coccodes Colletotrichum lori isu ọdunkun *
Nọmba apẹẹrẹ | Ọdunkun orisirisi | Ibi idagbasoke | Iwari ti C. coccodes | Iwọn ala-ilẹ |
---|---|---|---|---|
1 | Pupa pupa | Kostroma agbegbe | + | 35 |
2 | + | 35 | ||
3 | - | 38 | ||
4 | Sante | Agbegbe Moscow | + | 34 |
5 | - | |||
6 | - | 41 | ||
7 | - | 41.8 | ||
8 | + | 30 | ||
9 | Zhukovsky ni kutukutu | Agbegbe Moscow | - | 40.5 |
10 | - | 40.6 | ||
11 | - | |||
12 | Molly | Kaluga agbegbe | + | 34.3 |
13 | - | 38.4 | ||
14 | Irokuro | Kaluga agbegbe | - | |
15 | Gala | Nizhny Novgorod agbegbe. | - | |
16 | - |
Akiyesi. * Iye DNA ni gbogbo awọn ayẹwo jẹ 50 ng.
Tabili 5. Wiwa awọn coccodes Colletotrichum lori awọn ewe tomati *
Nọmba apẹẹrẹ | Ibi idagbasoke | Iwari ti C. coccodes | Iwọn ala-ilẹ |
---|---|---|---|
1 | Agbegbe Krasnodar, agbegbe Crimea | - | |
2 | - | ||
3 | - | ||
4 | - | 45 | |
5 | - | ||
6 | - | ||
7 | - | ||
8 | - | ||
9 | Agbegbe Krasnodar, agbegbe Yeisk | - | 39.2 |
10 | - | 40.8 | |
11 | - | ||
12 | - | 41.6 | |
13 | - | 40 | |
14 | - | 41 | |
15 | - | 41.9 | |
16 | - | ||
17 | - | ||
18 | - | 40.3 | |
19 | - | ||
20 | - | ||
21 | + | 34.5 | |
22 | - | ||
23 | - |
* Iye DNA ni gbogbo awọn ayẹwo jẹ 50 ng.
Eto idanwo ti a ṣẹda ko kere si eyiti idagbasoke nipasẹ awọn oniwadi Gẹẹsi (Cullen et al., 2002) ni ifamọ ati iyasọtọ ati pe o dara fun itupalẹ awọn apẹẹrẹ ọgbin. Lilo rẹ fun itupalẹ awọn isu irugbin jẹ ki o ṣee ṣe lati rii C. coccodes DNA ninu isu laisi awọn ami ita ti ibajẹ ati lati ṣe itupalẹ ikolu ti awọn ewe.
Ni Russia, titi di oni, awọn isu ọdunkun ko ti ṣe itupalẹ fun ikolu C. coccodes. Iwadi akọkọ wa fihan pe ninu awọn isu irugbin 16 idanwo ti o dagba ni awọn agbegbe oriṣiriṣi ti Russian Federation, 5 ni C. coccodes. Eyi fihan pe aaye dudu ti isu ọdunkun jẹ arun ọdunkun ti o wọpọ ni Russia, ati pe ipa rẹ ni idinku iwọn didun ati didara irugbin ọdunkun jẹ aibikita.
Nigbati o ba n ṣe itupalẹ awọn ewe tomati, wiwa ti o gbẹkẹle ti C. coccodes DNA ni a rii ni ewe kan lati agbegbe Yeisk ti agbegbe Krasnodar. Ni iṣaaju, nigbati o ṣe ayẹwo awọn aaye tomati ni gusu Russia nipa lilo eto idanwo British (Cullen et al., 2002), awọn leaves ti o ni C. coccodes ni a mọ, ati ni awọn aaye kan ti o pọju ti awọn leaves ti o ni ipa nipasẹ C. coccodes (Belov et al. al., 2018). Ni awọn agbegbe Krasnodar ati Primorsky ati agbegbe Moscow, a ṣe awari awọn eso tomati, lati inu eyiti a le ya sọtọ awọn aṣa mimọ ti C. coccodes. O ṣee ṣe pe C. coccodes jẹ eyiti o tan kaakiri pupọ lori awọn tomati ni Russia ju eyiti a gbagbọ lọwọlọwọ, ati pe ipalara rẹ tun jẹ aibikita.
Nitorinaa, titi di oni, alaye ti o to ti kojọpọ lori pinpin kaakiri ti C. coccodes lori poteto ati awọn tomati.
Lati ni oye daradara ipa ti fungus yii ni idagbasoke ti ọdunkun ati awọn arun tomati, ibojuwo lọpọlọpọ ti itankalẹ rẹ ni Russia, iwadi ti ipa ti ile ati awọn akoran irugbin, ati ipa ti aaye dudu ni awọn adanu ipamọ jẹ pataki. Lilo awọn iwadii aisan PCR le dẹrọ iṣẹ yii ni pataki, ati lilo nigbakanna ti awọn eto idanwo mejeeji yoo mu išedede ti itupalẹ pọ si.
Iṣẹ naa ni atilẹyin nipasẹ ẹbun Imọ-ẹkọ Imọ-jinlẹ ti Ilu Rọsia No.. 18-76-00009.
A ṣe atẹjade nkan naa ninu iwe akọọlẹ “Mycology ati Phytopathology” (Vol. 54, No. 1, 2020).